全病毒疫苗使用弱化（減毒）或滅活形式的病原體，導(dǎo)致疾病觸發(fā)針對其的保護(hù)性免疫。全病毒疫苗有兩種類型。減毒活疫苗使用病毒的弱化形式，它仍然可以生長和復(fù)制，但不會引起疾病。滅活疫苗含有病毒，其遺傳物質(zhì)已被熱、化學(xué)物質(zhì)或輻射破壞，因此它們無法感染細(xì)胞和復(fù)制，但仍可引發(fā)免疫反應(yīng)。

兩者都是久經(jīng)考驗(yàn)的疫苗接種策略，它們構(gòu)成了許多現(xiàn)有疫苗的基礎(chǔ) - 包括黃熱病和麻疹疫苗（減毒活疫苗）或季節(jié)性流感和甲型肝炎疫苗（滅活疫苗）。還存在細(xì)菌減毒疫苗，例如用于結(jié)核病的 BCG 疫苗。

減毒活疫苗的優(yōu)缺點(diǎn)包括：這是一項(xiàng)成熟的技術(shù)，可誘導(dǎo)強(qiáng)大的免疫反應(yīng)，涉及B細(xì)胞和T細(xì)胞；生產(chǎn)相對簡單，但不適合免疫系統(tǒng)受損的人，在極少數(shù)情況下可能引發(fā)疾??；而且此類產(chǎn)品通常對溫度相對敏感, 所以小心儲存很有必要。

滅活疫苗同樣是成熟的技術(shù)，且適合免疫系統(tǒng)受損的人，由于其沒有活性成分，因此沒有疫苗引發(fā)疾病的風(fēng)險(xiǎn)；此列疫苗的生產(chǎn)相對簡單，且產(chǎn)品相對穩(wěn)定；但可能需要加強(qiáng)免疫。

減毒活疫苗和滅活疫苗都含有全部或部分致病病原體，但它們引發(fā)的免疫類型略有不同。

減毒活疫苗來源于在實(shí)驗(yàn)室條件下被削弱的病毒，因此在注射時(shí)它們會感染細(xì)胞并進(jìn)行復(fù)制，但不會引起疾病或只會引起非常輕微的疾病。不過，它們可能不適合免疫系統(tǒng)受損的人（例如 HIV 感染者）和孕婦，因?yàn)榧词故侨趸牟《疽部赡芤l(fā)這些人的疾病。此外，在極少數(shù)情況下，減毒活疫苗可以恢復(fù)為更具致病性的形式，從而引發(fā)接種疫苗的個(gè)人或其接觸者的疾病。

因?yàn)檫@些疫苗只是天然病原體的弱化版本，免疫系統(tǒng)會像對待任何其它細(xì)胞入侵者一樣做出反應(yīng)，調(diào)動一系列防御措施來對抗它，包括殺傷性 T 細(xì)胞（識別和摧毀受感染的細(xì)胞）、輔助性 T 細(xì)胞（支持抗體的產(chǎn)生）和產(chǎn)生抗體的 B 細(xì)胞（其目標(biāo)是潛伏在身體其它部位的病原體，例如血液）。這種免疫反應(yīng)會一直持續(xù)到病毒從體內(nèi)清除，這意味著記憶細(xì)胞有足夠的時(shí)間來發(fā)展抵抗病毒的能力。正因?yàn)槿绱耍瑴p毒活疫苗可以引發(fā)免疫反應(yīng)，幾乎與接觸野生病毒一樣，但不會致病。

滅活病毒疫苗也含有致病病毒或部分病毒，但它們的遺傳物質(zhì)已被破壞。出于這個(gè)原因，它們被認(rèn)為比減毒活疫苗更安全、更穩(wěn)定，并且可以給予免疫系統(tǒng)受損的人。盡管它們的遺傳物質(zhì)已被破壞，但滅活病毒通常含有許多免疫系統(tǒng)可以反應(yīng)的蛋白質(zhì)。但因?yàn)樗鼈儾荒芨腥炯?xì)胞，滅活疫苗只能刺激抗體介導(dǎo)的反應(yīng)，而且這種反應(yīng)可能更弱，壽命也更短。為了克服這個(gè)問題，滅活疫苗通常與佐劑一起使用，并且可能需要加強(qiáng)免疫。

不同的病毒需要略有不同的生產(chǎn)策略，這意味著每種病毒都需要單獨(dú)的設(shè)備和設(shè)施。例如，流感病毒在受精雞蛋內(nèi)生長 - 這些雞蛋本身必須來自專門的無菌產(chǎn)蛋設(shè)施。脊髓灰質(zhì)炎病毒在需要不同處理的細(xì)胞培養(yǎng)皿中生長，而基于細(xì)菌的疫苗則在巨大的生物反應(yīng)器中生長?；畈≡w的生長也意味著必須采取嚴(yán)格的預(yù)防措施，以避免病毒逃逸。

一旦培養(yǎng)出大量病毒或細(xì)菌，就必須將它們分離、純化、減毒或滅活，具體取決于疫苗。這些步驟中的每一個(gè)都需要特定的設(shè)備、試劑和嚴(yán)格的程序來避免和檢查污染，這會進(jìn)一步增加成本。